SGE作业调度系统

不要在登录节点（管理节点）上运行大型程序

• qrsh登录计算节点

• qsub递交批量任务

  创建work.sh文件：

  #!/bin/bash
  #$ -S /bin/bash
  #$ -N JobName
  #$ -cwd
  #$ -j y
  #$ -pe smp 5
  #$ -l mem_free=6G,h_vmem=6G
  需要执行的任务命令

  提交任务：qsub work.sh

  查看任务运行情况：qstat

  删除任务：qdel 139

详解：

1. Use the -pe local K option to request K slots on a single cluster node.
2. use the -R y option to turn on slot reservation.
3. Use the mem_free=NG option to specify N Gigabytes of memory your job(指定作业多少G内存).
4. Use h_vmem= nG to set the hard memory limit for your job. Important: the value, n, you set in h_vmem is the total memory you set via mem_free divided by the number of slots specified for -pe. In other words n=N/K.
5. -S shell_path：指定运行Shell环境
6. -N job_name：重命名作业名
7. -cwd：从当前工作路径运行作业
8. -j y[es]|n[o]：定义作业的标准错误输出是否写入到输出文件中

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